陈瀚指挥海东四路海陆大军同时出击，陈寅、刘忠信、杨文率两万陆军收复绍兴府，在萧山县追上撒施洛统率的一万余西班牙大军及汉奸仆从军，双方在萧山县即将展开会战，驻守杭州城的马丁·德戈伊蒂忙率两千大军渡江赶来增援。
陈瀚同陆启航率海陆大军一万五千经杭州湾直奔钱塘江杀来，陆启航率东海海军第二编队六十余艘战舰封锁钱塘江，陈瀚亲自指挥六千禁卫军、御林军及部分虎贲军骑兵等陆军炮军将士在侯朝门外登陆作战。
“杀光西寇汉奸走狗，拿下杭州城。”刚在侯潮门外钱塘江北岸登陆的海东将士蜂拥朝着残破坍塌后被清理干净的侯潮门冲杀而来，喊杀声震天：“冲啊……”
杭州城中只有五百西班牙兵及一千汉奸仆从军镇守，杭州城东城墙上的西班牙兵及汉奸仆从军看着海东大军蜂拥冲杀而来，汉奸仆从军吓得顿时一哄而散，西班牙将士见汉奸仆从军逃跑，也跟着逃跑。
六千海东大军从残破坍塌的侯潮门冲杀进杭州城来，驻守侯潮门的西班牙兵及汉奸仆从军纷纷吓得惊慌失措四散而逃，海东军迅速控制侯潮门、凤山门、永昌门城南一带，王旭率着三千禁卫军陆军将士追杀上去。
身穿银白钢盔甲全副武装到牙齿的陈瀚身披大红披风，胯下一匹枣红高头大马，正骑马进城，两千御林军沿街进城驻守，六百虎贲军在前开道，六百御林军在后护卫着六辆美姬们马车跟着进城，杭州城中城北喊杀声震天，枪声、炮声此起彼伏响起。
王旭秦勇率禁卫军御林军及千余陆军兵分数路追杀上去，杀得汉奸仆从军在城中仓皇逃窜，海东大军迅速控制城中城北大部分城门，走投无路的汉奸仆从军纷纷跪地磕头求降：“我们愿降，我们愿降，别杀我们，……。”
五百西班牙兵慌忙朝着城北武林门逃来，匆忙开城而逃。林勇正率千余将士驾着十几艘平底沙船从江南大运河上赶来，见西班牙兵正要渡河，忙下令道：“发炮进攻”
十几艘沙船上的将领纷纷高呼下令道：“放”
‘轰轰……’沙船上舰炮发炮猛轰武林门外西班牙兵，西班牙兵顿时惨死一片，王旭在后率千余禁卫军追杀出城来将还未死透的西班牙兵悉数杀光，枭首城外示众。
陈瀚收复杭州城后将巡抚衙门及临近的浙江三司衙门一并征用当做临时行宫，陈瀚随即下令将领严加约束大军军纪，安抚民心，尽快恢复杭州城秩序。
撒施洛同马丁·德戈伊蒂统率一万八千西班牙兵及汉奸仆从军原本准备在萧山与海东军展开决战，钱塘江被海东海军封锁，杭州城被海东大军趁虚而入攻下的消息传来，西班牙大军及汉奸仆从军开始军心不稳起来，不少汉奸仆从军纷纷连夜开溜。
撒施洛同马丁·德戈伊蒂慌忙在次日一早率近万西班牙兵及汉奸仆从军仓皇南逃诸暨县，陈寅、杨文随即率一万六千大军在后追杀而去。
何崇奇率东洋海军第三编队搭载刘雄、郑彦武统率的一万虎贲军骑兵陆军炮军将士渡海在海盐县海宁卫登陆作战，何崇奇指挥东洋海军发炮一通猛轰海盐县城，刘雄随即率虎贲军骑兵一举攻占海盐县城，何崇奇随即率东洋海军第三编队主力返回舟山驻守。
一万余海东大军大举北上收复嘉兴府，一路势如破竹，接连收复平湖县、嘉兴府城、嘉善县，郑彦武率三千大军驻守嘉兴府城，出兵南下收复桐乡县及湖州府，刘雄率五千虎贲军骑兵及陆军炮军乘胜沿江南大运河北上攻入南直隶，准备收复苏州府。
吴建从处州府败逃回金华府，为提振军心士气，笼络手下，吴建宣布脱离西班牙远征军，在金华府称帝，国号大吴，大封文武百官，封其弟吴昌为豫章王，统率五千大军出兵进攻江西广信府（上饶），又派出三千大军进攻南直隶徽州府。
吴建亲率两万余白莲教罗教信徒饥民流民贫苦百姓组成的乱贼大军在武义县迎战正大举北上进攻的海东北伐大军陈冲率领的中路军，陈冲派先锋将领秦义久率两千萨摩精兵冲杀在前，一举击溃吴建两万乌合之众，斩杀数千白莲教罗教反贼，趁胜收复金华府。
五千海东北伐大军中路军偏师在李固率领下从处州府城丽水北上松阳县、遂昌县，翻山越岭突袭进攻并一举收复衢州府城西安，接连收复江山、龙游、常山诸县，与陈冲大军遥相呼应，夹攻汉奸白莲反贼吴建。
吴建面对海东大军前后夹攻，慌忙率着近万残兵败将逃往严州府，撒施洛、马丁·德戈伊蒂被陈寅、杨文率一万六千海东大明联军一路追杀得死伤惨重，马丁·德戈伊蒂被陈寅追杀赶来斩于马下，撒施洛带着五千残兵败将逃到严州府城与吴建汇合。
海东军主将陈冲、陈寅、李固及浙江参将杨文等统率三万余大军进剿败逃到严州府合流的一万三千余白莲反贼西班牙残兵败将，吴建、撒施洛面对海东大明联军围剿，慌忙率残兵败将沿着新安江逆流北上逃往南直隶徽州府。
吴昌率五千白莲教反贼大军攻入江西，一举攻下广信府各县，随即大举进攻饶州府、抚州府。遭到刘庆、郭国安、徐为斌出兵镇压的邵武府罗教反贼也纷纷败退到江西建昌府与建昌府罗教反贼合流，随即向吴昌请求增援。
刘庆、郭国安率两万海东大军控制邵武府、建宁府北部与浙江江西边界险要关口，出兵进攻建昌府白莲教、罗教反贼，刘庆采用攻心为上，攻城次之策略，对依附反贼生存的饥民流民展开攻心瓦解宣传，但凡主动投降归顺会得到海东国分配土地粮食，得到不少饥民流民贫民响应主动赶来投靠海东军。
郭国安、徐为斌率一万大军在江西建昌府城南城击破吴昌统率的两万余白莲教罗教信徒饥民流民大军，斩杀白莲教罗教骨干教徒两千余人，俘获一万余饥民流民，大挫攻入江西的吴昌白莲反贼大军。
江西巡抚庄国桢调集两万余江西明军同福建明军海东大军对吴昌率领的近万白莲教罗教残兵败将展开围剿，吴昌慌忙朝着饶州府逃去。
郭国安按照刘庆军令将围剿白莲教罗教残余反贼的大好机会留给明军将士，以防止浙江白莲反贼进入江西为由派兵接替明军驻守抚州府、广信府。