赵构率领十万马嵬军，童贯率领八万河东番汉兵，谭稹率领三万禁兵，一同把方腊围困在青溪县一带。
青溪县一带，方腊的群众基础甚好，一时之间，两军相持。
却说，方七佛自从率众七万起义军进攻秀州，失败之后，方七佛的嫡系部队，几乎损失殆，方七佛觉得不能再听从方百花的命令。
方七佛半路被方百花逼着，再次攻打秀州失败，方七佛和方百花一道退守杭州城，方七佛听说，方腊率领的五十万起义军，竟然被阻杀十五万之多，方七佛见形势不妙，便偷偷准备撤离。
1121年二月，赵构率领的宋军包围杭州时，郑皇后和太子殿下怕赵构再立战功，便指示朝中大臣上书招降方腊，如此一来就可以大大减少赵构的战功。
于是，宋徽宗下诏“招抚方腊”，却不想被方腊拒绝，方腊亲自指挥抵抗，战斗打的异常激烈。
赵构和韩世忠也没有更好的办法，只得派兵围城，断绝杭州城内的粮草供应，数十天后，城中缺粮，杭州城内的百姓又不支持方腊起义军，方腊只得带领起义军撤出杭州。
同年三月，方腊不甘心就此败于赵构，又率起义军再次进攻杭州，在城外便被王禀打败。
方七佛便率领三千余名心腹士兵，准备逃往洞庭湖一带。
武松早就关注着方七佛，武松带领数千人马，一路追赶，终于，追上方七佛，谁方七佛手上武艺不弱，武松被砍一只手。
武松匆匆包扎一下，发起狠来，单手生擒方七佛。
武松把方七佛带回营中，
赵构看着武松只剩一只手，心里很不是滋味，赵构命军医给武松治伤。
赵构说：“方七佛，本王说过，我一定要亲手抓住你，你看现如今，你成了本王的监下之囚。”
方七佛说：“赵构，我是你抓住的吗？你有脸说些大话吗？赵构你要是不服气，便与我单打独斗。”
赵构笑了笑，心想本王才不会跟你比。
高庞说：“九皇子，就让属下与方七佛比一场。”
赵构点了点头。
高庞对方七佛本来就有气，如今能够大打出手，自然是下手不容情，方七佛被高庞暴击，方七佛也没想到这高庞今日如此厉害。
原来高庞前几次都是，为了保护赵构而分心，根本而用全力攻击方七佛，如今赤手空拳对打，又是高庞的强项。
高庞把方七佛打得进气的多，出气的少。
黄金善，此时，也上前狠狠地踢了几脚方七佛。
赵构命人把方七佛带下去。
却说，方腊失去了杭州，形势急转直下，叛军从节节胜利变成节节败退。
不久歙州、睦州、衢州也先后被赵构夺回，方腊起义军从富阳、新城、桐庐一路退到青溪县，最后退守帮源洞。
此时起义军还有二十万人，但战斗力却大大下降，这些个起义军原本就是被方腊一行逼着从军的，如今见官军来了，纷纷逃离，或者遇官军便败逃。
1121年5月12日，赵构指挥宋军包围帮源洞，方腊在石洞中躲藏起来，由于石洞极为隐蔽，宋军一时之间，也不知如何进入，损失不少人马，强攻是肯定不行的。
赵构领的马嵬军一时之间也对源洞束手无措，裨将韩世忠领命前去侦查，终于在抓获得降兵中，得知帮源洞内详情。
方腊在帮源洞内，还有七万人马。
韩世忠说：“九皇子，这帮源洞附近山高密林，不利于大部队开展，不如由我组织数千敢战士，前往侦查。”
赵构对帮源洞还是有些印象，当日被关在帮源洞中，约数十日，只是当时被蒙住眼，后来在杨沂中的帮助下，逃离帮源洞，只不过当时，也有注意帮源洞周围的地形风貌。
赵构决定亲自参与侦查帮源洞，赵构、韩世忠、杨沂中、高庞、黄金善，等人带领五千名敢战士，经过数日侦查，终于发现帮源洞的入口处。
韩世忠率领五千名敢战士，杀入帮源洞。
赵构又命8万名马嵬军，一同进攻帮源洞，把帮源洞内七万方腊起义军连根拨起。
方腊、方肥带领一众亲信，逃往忠州，被忠州防御使辛兴宗擒获。
辛兴宗把方腊、方肥等一众人，押到赵构营帐前。
赵构说：“方腊，本王，敬你是一条汉子，不如投降于本王，本王可以饶你一命。”
方腊破口大骂，心不到当日手软，如今养虎为患，当时就不应该听信方百花，把赵构的命留下来。
赵构皱起眉头，知道方腊一行人是不会投降，便把方腊押往汴京城。
太子赵桓数次派人招降方腊未果，后又亲自上劝降，无奈方腊不愿投降，方腊心说，又不是你打败我的，我凭什么要向你投降。
1121年10月6日，太子赵桓已经渐渐失去耐心，于是便和朝中大臣上书，把方腊绞杀。