高一功在北线尾与荷兰人大战的时候，郑成功也正在率领大军围攻赤嵌城。
赤嵌城内的荷兰人已经将炮口调转过来，全部朝向了郑成功的大军。
台湾岛上的原住民一直受到荷兰人的压榨，他们看到大顺军登岛，知道郑成功是来赶走荷兰人的，纷纷上来帮忙。
不仅帮忙往岸上运送粮草、辎重，还帮忙在附近树林里砍树，帮助郑成功的大军搭建云梯。
之前郑成功的大军水战很厉害，但是对于陆战，特别是攻城却不那么擅长。
而大顺的士兵正好弥补了这一不足，大顺军士兵南征北战，攻城无数，小小的赤嵌城自然不在话下。
郑成功已经命人将运载过来的红夷大炮摆到城下。
他一声令下，众炮齐发，不断炮击着城墙上的荷兰守军。
荷兰人也不断利用城上布置的大炮还击。
双方部队互有伤亡。
正在郑成功准备命令步兵开始架设云梯登城时，从台湾城内派出的300人的荷兰支援小队赶到了赤嵌城周围。
荷兰人依然自信十足，300人的小队组成了两个小方阵，径直向郑成功的大军冲了过去。
郑成功发现荷兰这几百人的援军后，冷笑一声。
他调拨了两门红夷大炮，炮口分别转向到荷兰士兵的两个方阵，然后调用两千鸟铳手来对付这批荷兰士兵，其他士兵继续攻城。
在大炮的轰击下，荷兰士兵的方阵很快解体，荷兰兵不敢再组成方阵，而是两两、三三人一组，不停向大顺军射击。
而大顺军的鸟铳手火力显然要远远强于荷兰士兵。
一排鸟铳手放完枪后，不少荷兰士兵倒下。
还没有轮到大顺军第三排的鸟铳手放枪，荷兰士兵已经顶不住开始后退。
大顺士兵并没有放过他们，不断前进，不断射击，将他们逼到了岸边。
很多荷兰士兵慌不择路，选择跳入了海中。
这一路的荷兰援军也同样被击退。
最后一路，荷兰人想从海上进入台江进攻大顺军停留在台江内的战船。
可是荷兰人的主力战船只有三艘，等他们将船开到台江之后，一下子傻了眼。
台江内，大顺军一百多条战船，密密麻麻遍布在海面上。
虽然荷兰人的战船更大一些，火炮性能更强，但是大顺军战船数量依然占绝对优势......
荷兰人区区三条战船一进到台江就迅速被郑成功的水军战船包围。
几十条船打一条船，开始了对荷兰人的群殴。
大顺战船一贴近荷兰人的战船之后，水军士兵立刻搭上木板，跳帮到荷兰人的船上拼杀。
战船的荷兰士兵被蜂拥而来的大顺士兵迅速杀光。
荷兰人的最后一路援军也很快战败。
赤嵌城城内的荷兰守军本来看到自己的援军抵达很是高兴。
可是很快发现，城外援军不见了踪影，又只剩下了大顺士兵。
赤嵌城再次成了一座孤城，它与台湾城的联系也彻底被切断。
郑成功在派人攻城的同时，也在当地原着民的帮助下切断了赤嵌城的水源。
面对如此猛烈进攻，又被切断了淡水，城内的荷兰守兵很快失去了抵抗的动力，城内的守将打出了白旗，向郑成功投降。
赤嵌城的荷兰人投降后，为了进一步劝降台湾城的荷兰人，郑成功对他们并没有加害，而是暂时将他们软禁了起来。
之后，郑成功在城内留下了少量士兵看守，带领大军又奔向了台湾城。
台湾城作为当时荷兰在台湾的统治中心，城池建设的要比赤嵌城更加高大而坚固，并且城池的防御设施也更加完善。
台湾城城墙高达10余米，更有深度达3米多的地基，城池用特制的糖水调灰垒砖建成，城墙比石头还要坚固。
台湾城的四个角设置有炮台，城墙上放置的各种火炮达数十尊，并且荷兰人的火炮射程远、威力大。
荷兰人妄想凭借坚固的城墙和强大的火炮坚守待援，等待巴达维亚的援军来救。
郑成功将全部携带的红夷大炮全部运到了台湾城下。
他一面命人不断轰击城墙上的守兵，给城内台湾总督压力，一面不断向城内射去劝降信，劝荷兰人投降。
可是荷兰人气焰十分嚣张，对郑成功的劝降信置之不理。
郑成功见劝降无效，下令士兵开始全面攻城。
就在台湾城攻城战进行的同时，台湾外围海域的海面上，荷兰人的巴达维亚援军也已经抵达。
不过此时海面风浪太大，而且也有大顺军的大量战船部署在沿岸，荷兰援军一直踌躇不前，不敢贸然进兵。
高一功率领全部海军战船阻截荷兰援军。
荷兰人的城池虽然坚固，火炮威力很大。
不过台湾城与大陆内的其他大城比起来如弹丸一般，并且大顺军的士兵人数众多，而且作战勇猛。
在大炮的掩护下，不畏生死的大顺军士兵凭借云梯，很快登上了台湾城的城墙，杀出来一个缺口。
荷兰守兵一阵惊慌，不断派人增援缺口处的守军，城墙上的防线开始出现混乱。
大顺军士兵看到了机会，越来越多的士兵登上了城墙。
很快整个城墙都被大顺士兵占领，士兵顺利攻入了台湾城。
城内的荷兰总督见状，果断决定投降，他立刻命令士兵竖起了白旗。
郑成功成功攻占台湾城后，立刻逼迫已经成为俘虏的荷兰总督签下协议，承诺荷兰人永久不再涉足台湾，退出中国沿海的贸易。
同时大顺军也承诺不再杀害俘虏的荷兰士兵，放他们回去。
一切都已经谈好后，郑成功送一名荷兰俘虏去见他们的援军守将，说明情况。
荷兰援军见大顺军势大，而且台湾岛的两座城都已经被大顺军攻破，只能顺水推舟，承认了郑成功和台湾总督签署的协议。
荷兰援军来后一枪没放，带着台湾的荷兰人全部灰溜溜地撤回了巴达维亚城。
自此，大顺军在郑成功的帮助下收复了台湾。
台湾成了大顺水军新的基地，也成了大顺军在东南沿海的一个抗清基地。