奥斯曼帝国的力量也被法国用于应对欧洲舞台上的宗教冲突。
1566年，在查理九世（charles Ix）统治下，法国驻奥斯曼帝国大使在威廉一世（william I of orange）请求奥斯曼援助后，介入支持荷兰反抗西班牙帝国的斗争，因此考虑建立荷兰与奥斯曼帝国的联盟，并从苏莱曼大帝那里向弗兰德（Flanders）的“路德教徒”发出了一封信，承诺在他们请求时提供部队，并声称与他们感同身受，“因为他们不崇拜偶像，相信独一的上帝，并且与教皇和皇帝作斗争”。
当时，奥斯曼帝国确实以宗教宽容而闻名。
各种宗教难民，如胡格诺派（huguenots）、一些英国国教徒（Anglicans）、贵格会徒（quakers）、重洗派（Anabaptists）以及耶稣会士（Jesuits）、小修道院士（capuchins）和犹太人（马拉诺人，marranos）都能在君士坦丁堡和奥斯曼帝国找到避难所，在那里他们享有居住和礼拜的权利。
此外，奥斯曼帝国还在特兰西瓦尼亚（transylvania）和匈牙利支持加尔文主义者，也支持法国的加尔文主义者。
当时的法国思想家让·博丹（Jean bodin）写道：
“土耳其的大皇帝以世界上任何王子的虔诚来尊重和遵循他从祖先那里继承的宗教，他并不厌恶他人奇异的宗教；
相反，他允许每个人按照自己的良心生活：
更重要的是，在他位于佩拉（pera）的宫殿附近，容忍四种不同的宗教，即犹太教、基督教、希腊教和伊斯兰教。”
—— 让·博丹。
法兰西王子亨利·德·瓦卢瓦（henri de Valois）于1572年当选为波兰国王，部分原因是波兰贵族希望讨好奥斯曼帝国。
当时，奥斯曼帝国处于其权力的巅峰，但在接下来的四十年里，法国将卷入激烈的法国宗教战争，而奥斯曼帝国的力量在1571年莱潘托战役（battle of Lepanto）后开始缓慢减弱。
1572年，在波兰国王齐格蒙特·奥古斯特（Sigismund Augustus）去世后，他曾与奥斯曼帝国保持联盟，波兰选举了法国的亨利·德·瓦卢瓦，而非哈布斯堡候选人，部分原因是希望更能迎合奥斯曼帝国。
亨利·德·瓦卢瓦的选择显然是由奥斯曼大维齐尔索科卢·穆罕默德·帕夏（Sokollu mehmet pasha）提议的。
亨利于1575年返回法国时，由斯特凡·巴托里（Stephen báthory）接替他，巴托里在1571年也得到了奥斯曼帝国的支持，获得了特兰西瓦尼亚王位。
1574年，威廉·奥兰治（william of orange）和法国的查理九世通过其支持胡格诺派的大使达克斯主教弗朗索瓦·德·诺阿耶（Fran?ois de Noailles）试图争取奥斯曼苏丹塞利姆二世（Selim II）的支持，以便向西班牙国王菲利普二世（philip II）发起新的进攻。
塞利姆二世通过一位使者提供了支持，使者试图将荷兰人与西班牙的反叛摩尔人（moriscos）和阿尔及尔的海盗联系起来。
塞利姆还派出了一支强大的舰队于1574年10月在突尼斯的攻占中取得成功，从而减轻了西班牙对荷兰的压力。
法国的胡格诺派与摩尔人在1570年代计划反对西班牙的行动中保持联系。
大约在1575年，计划制定了阿拉贡摩尔人和来自比阿尔的胡格诺派联合攻击西班牙阿拉贡的方案，该计划与阿尔及尔国王和奥斯曼帝国达成了一致，但由于约翰·奥地利（John of Austria）抵达阿拉贡以及摩尔人的解除武装，这些项目未能实现。
在1576年，一支来自君士坦丁堡的三路舰队计划在穆尔西亚（murcia）和巴伦西亚之间登陆，法国胡格诺派从北方入侵，摩里斯科人完成起义，但奥斯曼舰队未能抵达。
奥斯曼帝国将继续支持法国，并在 1580 年之后继续支持荷兰人和英国人，以及支持新教徒和加尔文主义者， 作为对抗哈布斯堡王朝在欧洲霸权企图的一种方式。
不过，奥斯曼-萨法维战争（1578-1590）一度将奥斯曼人的注意力从欧洲转移开。
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奥斯曼帝国与波斯之间的冲突促使后者试图与其他欧洲大国建立反对奥斯曼帝国的哈布斯堡-波斯联盟，特别是与哈布斯堡帝国、一些意大利国家和哈布斯堡西班牙。
这一计划通过两次重要的外交努力得以正式化：波斯驻欧洲大使馆（1599-1602）和波斯驻欧洲大使馆（1609-1615） 。
然而，结果似乎有限。
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在法奥联盟开始后的三个世纪里，奥斯曼帝国有效地继续尊重其保护境内基督教社区的承诺。
接替弗兰西斯一世的法国国王们通常也维持了亲奥斯曼的政策。
许多奥斯曼大使团被接待在法国宫廷：
1533年，苏莱曼一世向弗兰西斯一世派遣大使；
1565年，苏莱曼一世向查理九世（charles Ix）派遣的哈吉·穆拉德（hajji murad）大使团；
1571年，塞利姆二世（Selim II）向查理九世派遣大使；
1581年，穆拉德三世（murad III）向亨利三世（henry III）派遣大使。
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亨利四世（henry IV）登基之前，法国胡格诺派与摩尔人就针对哈布斯堡西班牙的计划进行接触。
大约在1575年，计划在阿拉贡的摩尔人与来自贝阿恩的胡格诺派一起发起联合攻击，目标是西班牙阿拉贡，这一计划得到了阿尔及尔的贝伊和奥斯曼帝国的支持，但在约翰·奥地利（John of Austria）抵达阿拉贡和摩尔人被解除武装后，这些项目夭折了。
1576年，计划从君士坦丁堡派出一支三叉舰队在穆尔西亚和瓦伦西亚之间登岸，而法国胡格诺派从北方入侵，摩尔人则进行起义，但奥斯曼舰队未能如期到达（同上）。
亨利四世继续实施法奥联盟政策，并于1601年接待了穆罕默德三世（mehmed III）的大使。
1604年，亨利四世与奥斯曼苏丹艾哈迈德一世（Ahmed I）签署了《和平条约与协定》，给予法国在奥斯曼帝国中的诸多优势。
1608年，一支由弗朗索瓦·萨瓦里·德·布雷夫（Fran?ois Savary de brèves）领导的大使团被派往突尼斯。
1607年，另一支大使团被派往路易十三（Louis xIII），1669年，穆罕默德四世（mehmed IV）向路易十四（Louis xIV）派遣的大使穆特费里卡·苏莱曼·阿嘎（muteferrika Suleyman A?a）在法国宫廷引起了轰动，甚至引发了一场土耳其风潮。
东方文化对法国文学产生了强烈影响，16世纪约50%的法国旅游指南都与奥斯曼帝国有关。
法国在君士坦丁堡的影响力仍然显着，1604年再次更新的协定迫使所有国家在法国的保护和旗帜下进行贸易，除了与荷兰共和国竞争影响力的英格兰和威尼斯。
在西方大国竞争影响力的背景下，法国与奥斯曼帝国的关系开始显着降温。
1643年，法国失去了对圣地的监护权，转交给了希腊人。