在亚雷辛观测站，科学家们紧张地盯着屏幕上的数据，他们的脸上写满了震惊和不安。突然，他们向xIG发布了紧急通告，报告了一个惊人的发现：一个不明天体正迅速接近地球。这个天体被命名为迪格罗布，它的出现打破了太空的宁静，也打破了xIG的平静。
乔姬和墩子立即开始分析迪格罗布的运行轨迹。经过一番复杂的计算和模拟，他们得出了一个结论：迪格罗布的运行轨迹并没有和地球重合。这个消息让石室指挥官松了一口气，他以为这意味着地球暂时安全了。然而，实际情况却跟他们的分析完全相反，迪格罗布的目的地就是地球。
与此同时，在地球的另一端，藤宫正站在美宝山的山顶上。他闭上眼睛，深吸一口气，然后变身成了阿古茹。他潜入地下，发现了一只沉睡的怪兽，它的名字叫仲耐尔。仲耐尔是藤宫此次行动的目标，他必须唤醒它。
藤宫直接使用阿古茹的力量将仲耐尔唤醒，“仲耐尔，来吧！”他大声说道。仲耐尔活动了下身体，美宝山瞬间剧烈震动了起来。但很快，震动又平息了。人们只当是地震，就都没当回事。毕竟，日本地震太频繁了，他们已经习惯了。
在xIG基地内，吉欧基地的樋口博士来到了xIG空中基地内。
他面对着众人，严肃地说道：“自从出现怪兽以来，他们好像能够互相感应似的。地球内部也出现了怪兽，所以我们怀疑这些怪兽原本就是存在于地球上的。我们推测这是因为根源性灭亡体的出现而唤醒了他们。”
石室指挥官点头道：“想不到，戈布居然是为了这个来到地球的。”
樋口博士指着屏幕上地图中闪烁的红点接着说道：“这一切还只是假设，但是地球上有许多不同的地方，都出现了从未有过的异常现象，这是已经被确认的地点。”
我梦看着地图上闪烁的红点，惊讶地说道：“这么多啊！”
樋口博士一脸严肃地接着说道：“这些珍贵无比、至关重要的资料原本是被严格保密且绝不对外公开的，但目前的形势极为特殊。就在最近短短数天内，竟然发生了多次有人妄图通过输入错误密码来非法调用这些机密信息的入侵事件！”说罢，他伸出手指，精准地指向地图上的一个格外醒目的亮点，并继续讲解道：“更为关键的是，绝大部分这样的入侵行为都高度集中在了这份特定的资料之上，也就是此处。”
这时，一直全神贯注倾听着的我梦突然开口说道：“这是美宝山。”刹那间，一种强烈的直觉涌上心头——他怀疑做出这些举动的很可能正是藤宫。想到这里，他毫不犹豫地立刻登上战机，向着美宝山的方向疾驰而去。
与此同时，在那座神秘的美宝山上，大地剧烈颤抖，仲耐尔从深深的地底猛然钻出，庞大的身躯出现在了地面之上。而一旁的藤宫手持着自己精心研发的声波控制器，正有条不紊地操作着，试图掌控仲耐尔的一举一动。
没过多久，我梦驾驶的战机便如闪电般抵达了美宝山。果不其然，他一眼就瞧见了正在操控仲耐尔的藤宫。藤宫也在第一时间注意到了我梦的到来，他抬起头，目光冰冷地直视着我梦，大声警告道：“别妄想阻拦我的计划！”说完，他毫不留恋地转身离去，只留下我梦站在原地，望着他渐行渐远的背影陷入沉思……
我梦便将美宝山出现仲耐尔的消息告知了石室指挥官，不过他并没有说藤宫的信息。
石室指挥官听到我梦的汇报后，立马命令酷龙队出击阻止仲耐尔的移动。
就在酷龙队与仲耐尔交战时，我梦通过电脑分析发现仲耐尔体内有热核反应现象，如果仲耐尔身体被破坏使得能量释放的话，会产生无法想象的灾难。
听到这个消息后，石室指挥官立刻命令酷龙队停止攻击。
然而一波未平一波又起，之前出现的不明天体迪格罗布突然改变轨道，以极快道速度向地球袭来，一旦发生撞击，地球可能会再次进入冰河时期。
于是石室指挥官立刻联系了欧洲防卫中心让他们发射导弹拦截迪格罗布，但并未成功拦截，反而使迪格罗布向地球飞来道速度更快了。
这使得xIG基地的众人十分苦恼，就在这时我梦带来了好消息，他发现如果利用仲耐尔体内的能量对准迪格罗布发射的话，就可以顺利破坏迪格罗布，解决这次危机。
“藤宫，你一开始就是这么计划的对不对。”我梦很是欣慰的说道，藤宫这次好像是选择了保护人类。
但当我梦继续分析时发现了一个可怕的事实，仲耐尔体内的能量虽然能破坏的迪格罗布，但爆炸产生的威力也能波及到方圆二十公里的地方，那些地方有可能会被夷为平地。也就是藤宫一开始就没打算保护人类，他只是想保护地球罢了。
我梦明白这个事情后，立刻拿出蓝宝锥变身成了盖亚，想要将仲耐尔带离地球，在远离地球的地方再通过仲耐尔体内的能量破坏迪格罗布。
藤宫见到我梦又要阻止他的计划，于是拿出蓝宝镯变身成了阿古茹把盖亚推开，然后掰开了仲耐尔的背部，将仲耐尔道能量完全释放攻击迪格罗布。
“看来我得帮下忙了，去吧海帕杰顿，将爆炸所产生的能量吸收掉吧。”勇治将海帕杰顿的胶囊抛到空中后说道。
光芒一闪，海帕杰顿来到了空中，而仲耐尔的能量正好与迪格罗布相撞，瞬间产生了巨大的能量，海帕杰顿立刻通过不断瞬移吸收这些爆炸产生的能量。
盖亚本来还想用自己的力量拦下爆炸所产生的能量的，但当他来到空中时却发现所有能量都被海帕杰顿吸收了，盖亚向海帕杰顿点头表示感谢后，便回到了地面上。
“又是这只怪兽，他为什么总是站在人类一边，难道人类对他有什么恩惠吗？”阿古茹看着空中的海帕杰顿疑惑的说道，他也没有想那么多便解除变身，变回了藤宫。
而盖亚并没有着急变回我梦，他将仲耐尔的尸体重新安葬回了地下，毕竟这次危机是这个怪兽帮忙才解决的。
此次事件也算得到了圆满结束，海帕杰顿也重新变回了胶囊回到了勇治手里。